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日本试管婴儿过程中一个决定性的环节就是胚胎移植，胚胎移植就是手术医生将体外培养的早期胚胎，移植回母体子宫内让其继续发育。当胚胎回到子宫之后，其着床发育的过程和自然怀孕没有区别，同样也需要妈妈的十月怀胎才能分娩。
日本试管首先到医院门诊挂号看诊。女方挂生殖健康与不孕专科，男方挂生殖男科。就诊时最好带上既往检查报告（验血、精液、超声报告等）以及腹腔镜、宫腔镜等手术记录，做过输卵管造影的患者一定要同时带上造影胶片。这样一来可以供医生初诊评估使用，还可避免重复检查。
患者可以适当进食富含蛋白质、维生素等营养物质的食物，如鸡蛋、芹菜等，有助于补充机体所需要的营养物质，还可以促进卵子的生成。同时，患者还可以适当进食富含雌激素的食物，如豆浆、豆腐等，也可以促进卵子的生成。
日本英医院做试管婴儿的过程中，会有两次手术，一次是取卵，一次是移植。取卵会有点痛。其过程是用一条比较长的针，通过阴道穿刺到卵巢里取卵。绝大多数人可以忍受这种痛感。如对痛觉比较敏感，可选择麻醉取卵，这样就不会感觉疼痛了，麻醉也不会影响卵子或胚胎的质量。